Nell'antichita, l'isola ha svolto un ruolo secondario durante le guerre persiane. Nel 480 a.C. la flotta del re persiano Xerxes e stata colpita da una tempesta ed e finita sulle rocce del litorale di Skiathos. In seguito la flotta greca dopo una piccola sconfitta ad Artemisio, e riuscita infine a distruggere del tutto la flotta persiana durante una battaglia navale a isola di Salamina.

Faceva parte della Lega Attica, finche perse la sua indipedenza. In seguito nel 200 a.C. venne distrutta completamente da Re Filippo II.
La famiglia genovese dei Ghisi, la eredito dai franchi con le prime crociate per poi sbolognarla ai veneziani dopo quasi duecento anni. I Ghisi, commercianti veneziani, fecero costruire nel 1207 un castello veneziano (Kastro in greco), una fortezza simile a quella di Bourtzi a Nafplio, posto a picco su un promontorio roccioso, che costitui un prezioso baluardo difensivo contro l'attacco dei pirati. All'interno c'erano numerose chiese, dove si rifugiavano a pregare gli isolani impauriti, pero si mostro inefficace. Cosi verso la meta del 14° secolo la capitale venne trasferita sulle parti che sta oggi.
ll solito maledetto pirata Chairredin Barbarossa la devasto nel 1537 per poi consegnarla ai turchi fino al 1829.

Nel 1704 e stato fondato il convento dell'Evangelistria (Il Monastero Evanghelistria), costruito dai monaci del Monte Athos, su una rocca tra colline verdissime ai piedi della cima piu alta dell'isola che ben presto divento rifugio dei ribelli greci. Il suo contributo verso l'indipedenza e notevole.

Nel 1829 ritorno alla madre patria e dal 1830 insieme alle Sporadi, cioe Skiathos, Skopelos, Alonissos, Skyros ed altri isolotti piu piccoli ed isolette compongono il Gruppo insulare dell'Egeo.

Durante il 19° secolo Skiathos divento un grande arsenale per la costruzione e la riparazione delle navi soprattutto peche fu ricoperta da folte pinete, usate come matteria prima nella costruzione delle navi.
I lavori sono stati sospesi per evitare la scomparsa delle pinete. Oggi sull'isola esiste un arsenale piccolo che costruisce i caicchi tradizionali del Mar Egeo.

Nel 1964 l'Ente nazionale per il turismo ha caratterizzato l'intera isola zona turistica. Skiathos e un'isola cosmopolita che offre infrastrutture alberghiere di ogni categoria e per ogni esigenza. La rete stradale e in continua espansione. L'isola non si puo definire certamente intatta. Le opere certamente hanno contribuito allo svillupo dell'isola. Skiathos e dotata di aeroporto dal 1984 e un'efficiente rete di trasporti marittimi che garantisce i collegamenti giornalieri con le altre isole dell'arcipelago, tramite un servizio di aliscafi e traghetti in partenza piu volte al giorno da Volos e da Aghios Kostantinos.
Veramente l'isola si e trasformata in una destinazione turistica molto importante.